Как проехать Контакты 
Библиотека
Общие сведения
Вход для зарегистрированных читателей
База данных АГРОС
Авторитетный файл наименований научных учреждений АПК
Библиотека-депозитарий ФАО
Издания
Выставки
Виртуальные выставки
Электронные библиотеки ЦНСХБ
Сельскохозяйственная Электронная Библиотека Знаний (СЭБиЗ)
Биографическая энциклопедия ученых-аграриев

ЦЭБС АПК
Сводный каталог библиотек АПК
Каталоги библиотек АПК
Обменный фонд
Электронная библиотека Сводного каталога
Ведомственный экземпляр НИУ

Услуги
Избирательное распространение информации
Доставка документов
Терминал удаленного доступа
Виртуальное библиографическое обслуживание
Форум читателей ЦНСХБ
Инструкции
Информационные услуги
Транслитерация
Баннеры ФГБНУ ЦНСХБ
Рейтинг@Mail.ru Яндекс.Метрика
[Ввод запроса]

^ШХР: П 1761 2012 57(4)
^АВТ: Демина Т.В. (Иркутский государственный медицинский университет). канд. биол. наук ; Джиоев Ю.П.; Козлова И.В.; Верхозина М.М.; Ткачев С.Е.; Дорощенко Е.К.; Лисак О.В.; Парамонов А.И. ; Злобин В.И.
^ЗГЛ: Генотипы 4 и 5 вируса клещевого энцефалита: особенности структуры геномов и возможный сценарий их формирования
^ВЫХ: Вопр.вирусологии, 2012; Т.57,N 4. - С. 13-19
^ДАТ: 2012
^ПРМ: Рез. англ..-Библиогр.:с.19
+Реферат

^РЕФ: Цель исследования - установить признаки своеобразия штаммов (ШТ) 178-79 и 886-84 как представителей самостоятельных генотипов 4 и 5 вируса клещевого энцефалита (ВКЭ). Использовано 2 выравненных набора нуклеотидной последовательности (НП) ШТ и изолятов ВКЭ, а также соответствующие им аминокислотные последовательности (АП). Один набор состоит из НП гена E длиной в 160 п.н. 643 ШТ, депонированных в GenBank, другой включает кодирующую часть полногеномных НП 32 ШТ ВКЭ. При сопоставлении короткого фрагмента гена E (позиции 567-727) можно установить генотипическую принадлежность того или иного ШТ. В последовательности 53 аминокислот, расшифрованных из данной НП, для дифференцировки ВКЭ значительными являются позиции E-206, E-232 и E-234. В позиции E-232 у ШТ 178-79 аланин замещен на валин, в позиции E-234 ШТ генотипа (ГТ) 1 и все ШТ ГТ2, а также ШТ 178-79 и 886-84 имеют аспарагин, большая часть изученных ШТ ГТ3 - гистидин, остальные - глутамин или тирозин. В позиции E-206 серин характерен для ГТ1, валин - для ГТ2, лейцин - для ГТ3, ШТ 178-79 имеет в этой позиции серин, ШТ 886-84 - лейцин. При сравнении кодирующей части полногеномных структур и короткого фрагмента гена E-232 ШТ ВКЭ отмечена общая закономерность, что ШТ 178-79 и 886-84 не входят ни в одну из групп, соответствующих 3 основным ГТ. Генетические структуры этих ШТ в большей степени гомологичны ШТ ГТ1 (11,2 и 12,6% различий) и более близки между собой (11,8% различий), чем ГТ3 и 2. В то же время при анализе 2-го набора определено, что ШТ 886-84 теснее связан со ШТ ГТ3 (12% различий) и более близок к ШТ ГТ1 (13,7% различий), чем к ШТ 178-79 (14,4%). В АП полипротеинов ШТ 178-79 и 886-84 чередование аминокислот сочетается с таковым ШТ 3 основных ГТ. Выявлены 3 аминокислотных остатка, являющиеся общими исключительно для этих 2 ШТ: изолейцин в позиции 109, лизин в позиции 2074 и аспарагиновая кислота в позиции 2515, расположенные относительно равномерно. Наименьшее количество уникальных замен обнаружено у ШТ 178-79, поэтому он отнесен к ГТ4, по уровню гомологии НП и АП примыкает к ГТ1. ШТ 886-84 отнесен к ГТ5, он имеет больше общего с ГТ2 и 3. Полученные факты дают представление о геномах ШТ 178-79 и 886-84 ГТ4 и 5 как о 2 вариантах "прикреплений" из последовательностей, характерных для ГТ1, 2 и 3. ГТ4 обнаружен на территории Вост. Сибири, ГТ5 - охватывает ареал Вост. Сибири и Сев. Монголии. Здесь же выявлены и варианты вируса ГТ1, 2 и 3, в результате чего создавались условия для одновременной репродукции вирусных частиц разных генетических линий в одной клетке, что способствовало образованию рекомбинантов. Т.о., результаты указывают на существование как минимум 5 генотипов ВКЭ.

^TRN: 1277608
^ВИД: Статья из журнала
^ЯЗК: Русский
+Индексирование



  назад   Главная страница ЦНСХБ  

Все права защищены 1998-2018 год ©Федеральное государственное бюджетное научное учреждение «Центральная научная сельскохозяйственная библиотека»