^ШХР: П 3009 2013 3
^АВТ: Лиманская О.Ю. (Институт микробиологии и иммунологии им. И.И. Мечникова Национальной академии медицинских наук Украины).; Муртазаева Л.А.; Klee S.; Лиманский А.П.
^ЗГЛ: Молекулярные технологии детекции возбудителя сибирской
язвы посредством ПЦР различных форматов
^ВЫХ: Биотехнология, 2013; N 3. - С. 86-96
^ДАТ: 2013
^ПРМ: Рез. англ..-Библиогр.:с.94-95
+Реферат:
^РЕФ: Определены маркеры для видоспецифической детекции возб.
сибирской язвы Bacillus anthracis и установлены отличия его от
близкородственных видов B. cereus и B. thuringiensis на основе
компьютерного анализа генов хромосомной ДНК с помощью
стандартной ПЦР (стПЦР) с электрофоретической детекцией и ПЦР
в реальном времени (ПЦР-РВ) с гибридизационно-флуоресцентной
детекцией, используя зонды различных форматов (линейный и
шпилечный). Разработаны наборы праймеров (ПР) и зонды для
ПЦР-РВ для отличия B. anthracis от B. cereus и B.
thuringiensis, а также наборы ПР для стПЦР. Для всех данных
представителей группы B. cereus sensu lato (B. cereus s.l.)
проанализированы нуклеотидные последовательности генов rpoB,
plcr и ssp., содержащихся в хромосомной ДНК, которые могут
являться молекулярно-генетическими маркерами для их
типирования. Мишенью для ПР и зондов определен фрагмент гена
ssp хромосомной ДНК, характеризующийся гексануклеотидной
вставкой только у штаммов (ШТ) B. anthracis. Стандартная ПЦР с
электрофоретической детекцией и разработанным набором ПР
(Banssp7A-Banssp8) позволила четко отличить бациллы B.
anthracis от близкородственных видов - B. cereus и B.
thuringiensis. Использование ПЦР-РВ с зондами в форматах
TaqMan и молекулярного маяка (ММ, линейного и шпилечного
соответственно) также дала возможность проводить точную
идентификацию B. anthracis: сигнал флуоресценции для шпилечных
проб в формате ММ был положительным только для ШТ B.
anthracis, а для др. представителей группы B. cereus s.l. -
отрицательным. При использовании линейных проб TaqMan
регистрировался высокоинтенсивный сигнал флуоресценции для
всех изолятов B. anthracis и сигнал значительно более низкой
интенсивности для др. представителей группы B. cereus s.l. При
проведении стПЦР с электрофоретической детекцией для B.
anthracis были характерны 2 полосы ампликонов, для остальных
представителей группы B.cereus s.l. - 1 полоса. Делается
вывод, что основой для успешной, высоконадежной детекции B.
anthracis может быть определенная, специфичная только для
него, хромосомная вставка в гене ssp (кодирующем
низкомолекулярный кислоторастворимый белок эндоспоры). Ил. 4.
Табл. 1. Библ. 35.
^TRN: 1373533
^ВИД: Статья из журнала
^ЯЗК: Русский
+Индексирование:
^РУБ: 68_41_53_33_27; 68_41_35_09
^УДК: 619:616.98:579.852.11-076:636; 619:579.852.11
^ТЕР: СИБИРСКАЯ ЯЗВА (Anthrax). BACILLUS ANTHRACIS.
ДИАГНОСТИКА (Diagnosis). PCR [АМПЛИФИКАЦИЯ IN VITRO;
ПОЛИМЕРАЗНАЯ ЦЕПНАЯ РЕАКЦИЯ; ПЦР; РЕАКЦИЯ ЦЕПНОЙ
ПОЛИМЕРИЗАЦИИ]. BACILLUS CEREUS. BACILLUS THURINGIENSIS.
ДИФФЕРЕНЦИАЛЬНАЯ ДИАГНОСТИКА (Differential diagnosis).
УКРАИНА (Ukraine) [РЕСПУБЛИКА УКРАИНА]. ФРГ (FRG)
[ГЕРМАНИЯ].
^РТЗ: BACILLACEAE. BACILLUS [БАЦИЛЛЫ; СПОРООБРАЗУЮЩИЕ
БАКТЕРИИ]. FIRMICUTES. PROKARYOTA [ПРОКАРИОТЫ].
БАКТЕРИАЛЬНЫЕ БОЛЕЗНИ ЖИВОТНЫХ [БАКТЕРИОЗЫ ЖИВОТНЫХ].
ВОСТОЧНАЯ ЕВРОПА (Eastern Europe). ЕВРАЗИЯ (Eurasia).
ЕВРОПА (Europe). ЗАПАДНАЯ ЕВРОПА (Western Europe).
ИНФЕКЦИОННЫЕ БОЛЕЗНИ ЖИВОТНЫХ. МЕТОДЫ (Methods).
МОЛЕКУЛЯРНО-ГЕНЕТИЧЕСКИЕ МЕТОДЫ. СНГ [СОЮЗ НЕЗАВИСИМЫХ
ГОСУДАРСТВ]. СТРАНЫ ЕС. СТРАНЫ МИРА. ЦЕНТРАЛЬНАЯ ЕВРОПА.