Как проехать Контакты 
Библиотека
Общие сведения
Вход для зарегистрированных читателей
База данных АГРОС
Авторитетный файл наименований научных учреждений АПК
Библиотека-депозитарий ФАО
Издания ЦНСХБ
Выставки
Виртуальные выставки
Конференции
Электронные библиотеки ЦНСХБ
Сельскохозяйственная Электронная Библиотека Знаний (СЭБиЗ)
Биографическая энциклопедия ученых-аграриев

ЦЭБС АПК
Сводный каталог библиотек АПК
Каталоги библиотек АПК
Обменный фонд
Электронная библиотека Сводного каталога
Ведомственный экземпляр НИУ

Услуги
Избирательное распространение информации
Доставка документов
Терминал удаленного доступа
Виртуальное библиографическое обслуживание
Форум читателей ЦНСХБ
Инструкции
Информационные услуги
Транслитерация
Баннеры ФГБНУ ЦНСХБ
Рейтинг@Mail.ru Яндекс.Метрика
[Ввод запроса]

^ШХР: П 1679 2013 5
^АВТ: Глазко В.И. (Российский государственный аграрный университет - МСХА им. К.А. Тимирязева. Москва). ; Косовский Г.Ю.
^ЗГЛ: Структура генов, кодирующих оболочечные белки ретровирусов птичьего гриппа и бычьего лейкоза
^ВЫХ: Докл.РАСХН, 2013; N 5. - С. 56-60
^ДАТ: 2013
^ПРМ: Рез. англ..-Библиогр.:с.59-60
+Реферат

^РЕФ: Проведен сравнительный анализ плотности распределения нуклеотидных последовательностей (НП), потенциально предрасположенных к формированию неканонических структур (НС) ДНК (G4-квадруплексов, G4-КВ), по длине генов гемагглютенина (HA) и нейраминидазы (NA)вируса гриппа A птиц (ВГП) H5N1, а также генов env и pol вируса лейкоза КРС (ВЛКРС). Исследовались НП сегмента HA (DQ366314, 1779 п.н.) и сегмента NA (DQ366316.1-GI:867537777,1401 п.н.). НП генов env (1548 п.н.) и pol (2538 п.н.) ВЛКРС были получены из секвенированных НП этих генов, представленных в GenBank (AF547184.2 и D00647.1). Во фрагменте гена HA длиной 1779 п.н. наблюдалось 7 неперекрывающихся потенциальных G4-KB (НП G4-KB) и 136 перекрывающихся НП, потенциально предрасположенных к формированию G4-KB. В основном они сосредоточены на 2 участках - сегменте длиной в 42 п.н. от 1076-го до 1117-го нуклеотида. НП от 1076-го до 1117-го нуклеотида кодирует 50 аминокислот, от 316-й до 363-й аминокислоты гена HA. Именно в этот участок (342-346-я аминокислота) попадает сайт, непосредственно связанный с вирулентностью ВГП. В исследованном фрагменте гена NA таких НП значительно меньше. В НП этого гена длиной в 1401 п.н. выявлено 4 НП G4-KB и 8 перекрывающихся, 3 из них расположены в сегменте от 543-го до 564-го нуклеотида. Т.о., более высокая генетическая гетерогенность HA по сравнению с геном NA совпала с высокой частотой встречаемости НП, предрасположенных к формированию G4-KB. Аналогичная тенденция была обнаружена при сравнении распределения потенциальных G4-KB в генах env и pol ВЛКРС. Так, в гене pol длиной в 2538 п.н. было обнаружено 10 НП G4-KB и 49 перекрывающихся, что существенно меньше плотности распределения последних по сравнению с геном env. Поиск участков гомологии к генам env и pol ВЛКРС в базах данных секвенированных последовательностей с применением программ Repeat Masker и Ciri показал, что в гене env такие участки не выявляются, а в гене pol - присутствуют: 209-486 - ERV3-2 CJa-I (66% гомологии, эндогенный ретровирус обезьяы); 1693-1755 DIRS-14 DR (70% гомологии, ретротранспозон зебрафиш); 1833-2156 ERV2-4 Cpo-I (64% гомологии, эндогенный ретровирус морской свинки); 2481-2522 - DNA-2-26 DR (79% гомологии, ДНК транспозон зебрафиш). Делается предположение, что относительно повышенная генетическая гетерогенность изолятов ВГП по гену HA в сравнении с геном NA и изолятов ВЛКРС по гену env в сравнении с геном pol может быть обусловлена разной плотностью механических участков ДНК в провирусной ДНК. Наличие НС в геномных участках ретровирусов, играющих главную роль в инфекционности, позволяет рассматривать возможность выявления и снижения их патогенности. Ил. 1. Табл. 2. Библ. 15.

^TRN: 1376014
^ВИД: Статья из журнала
^ЯЗК: Русский
+Индексирование



  назад   Главная страница ЦНСХБ  

Все права защищены 1998-2018 год ©Федеральное государственное бюджетное научное учреждение «Центральная научная сельскохозяйственная библиотека»