Как проехать Контакты 
Библиотека
Общие сведения
Вход для зарегистрированных читателей
База данных АГРОС
Авторитетный файл наименований научных учреждений АПК
Библиотека-депозитарий ФАО
Издания ЦНСХБ
Выставки
Виртуальные выставки
Конференции
Электронные библиотеки ЦНСХБ
Сельскохозяйственная Электронная Библиотека Знаний (СЭБиЗ)
Биографическая энциклопедия ученых-аграриев

ЦЭБС АПК
Сводный каталог библиотек АПК
Каталоги библиотек АПК
Обменный фонд
Электронная библиотека Сводного каталога
Ведомственный экземпляр НИУ

Услуги
Избирательное распространение информации
Доставка документов
Терминал удаленного доступа
Виртуальное библиографическое обслуживание
Форум читателей ЦНСХБ
Инструкции
Информационные услуги
Транслитерация
Баннеры ФГБНУ ЦНСХБ
Рейтинг@Mail.ru Яндекс.Метрика
[Ввод запроса]

^ШХР: П 2660Б 2015 50(6)
^АВТ: Денискова Т.Е. (Всероссийский научно-исследовательский институт животноводства им. Л. К. Эрнста. пос. Дубровицы, Московская обл.).; Доцев А.В. ; Гладырь Е.А.; Сермягин А.А.; Багиров В.А.; Хомподоева У.В.; Ильин А.Н.; Брем Г.; Зиновьева Н.А.
^ЗГЛ: Валидация панели SNP-маркеров для контроля происхождения локальных российских пород овец
^ВЫХ: С.-х.биология.Сер.Биология животных, 2015; Т.50,N 6. - С. 746-755
^ДАТ: 2015
^ПРМ: Рез. англ..-Библиогр.:с.753-754
+Реферат

^РЕФ: Создание панелей для контроля происхождения овец на основе наиболее высокоинформативных SNP (single nucleotide polymorphism) с частотой минорных аллелей MAF >= 0,3 - актуальная проблема овцеводства. Мы провели полногеномное исследование SNP у 4 аборигенных российских пород овец - романовской (ROM, n = 22), забайкальской тонкорунной (ZBL, n = 7), полугрубошерстной бурятской овцы Буубей (BUB, n = 15) и тувинской короткожирнохвостой (TUV, n = 16) с использованием Ovine SNP50k BeadChip. Обработку полученных данных проводили для общего числа маркеров (54241 SNP) и для 88 аутосомных SNP, рекомендованных ISAG. По результатам контроля качества всей выборки было отобрано 47385 SNP со средним значением MAF = 0,292±0,131. Значение MAF для 88 SNP происхождения составило 0,380±0,091. Большая часть SNP (81,8%) оказались информативными (MAF >=0,3). Доля информативных SNP различалась между породами и составляла 56,8% у ROM, 63,4% - у ZBL, 71,6% - у BUB и 72,7% - y TUV. При этом 21 SNP (23,9%) были высокоинформативны во всех 4 породах, 37 SNP (42,0%), 17 SNP (19,3%) и 10 SNP (11,4%) оказались информативными соответственно в трех, двух или только в одной породе. Маркер DU196132-525.1 был мономорфен у овец TUV (MAF = 0). Три SNP с MAF <0,3 (DU232924-365.1, DU501115-497.1 и DU372582-268.1) были неинформативны для всех 4 пород. Более низкие попарные значения Fst при использовании 88 SNP по сравнению с полногеномными SNP-профилями при сохранении характера выявленных связей подтвердили высокую универсальность панели ISAG. Низкая породная зависимость SNP панели подтверждалась формированием на PCA плоте слабо консолидированных перекрывающихся массивов, соответствующих отдельным породам. Полученные нами данные, хотя и обнаруживают некоторую породную зависимость панели ISAG, в целом показывают ее пригодность для контроля достоверности происхождения 4 аборигенных российских пород овец. Ил. 2. Табл. 2. Библ. 35.

^TRN: 1567826
^ВИД: Статья из журнала
^ЯЗК: Русский
+Индексирование



  назад   Главная страница ЦНСХБ  

Все права защищены 1998-2018 год ©Федеральное государственное бюджетное научное учреждение «Центральная научная сельскохозяйственная библиотека»